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XML JATS Redalyc en R2020

Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas.

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Marcalyc: Herramienta de marcación XML JATS.

Características de los productos de lectura generados con Marcalyc y su reutilización

Redalyc ha basado la publicación del contenido de las revistas indexadas en su sistema, en el formato XML JATS. Este formato, entre otras ventajas, permite la generación de diferentes productos de lectura. Entre ellos tenemos: PDF, HTML, ePUB.

Estos productos son generados de forma automática a partir del proceso de marcación utilizando el Sistema de Marcación XML JATS, denominado Marcalyc. Se emplean hojas de estilo especializadas para cada uno de ellos que permiten interpretar el contenido almacenado en el XML JATS y darle una salida con estilos predefinidos y así generar un producto de lectura estándar, con la identificación de la revista y con las especificaciones necesarias de una publicación científica.

Entre las principales características que se tienen de estos productos de lectura (PDF, HTML, ePUB), generados por Marcalyc, se mencionan:

  • La generación automática sin necesidad de utilizar una diagramación especializada para cada artículo y para cada producto (ahorro de tiempo y de costos).
  • La inclusión de metadatos tomados directamente del contenido del artículo lo que facilita su recuperación adecuada a través de los buscadores de información.
  • La reutilización de estos formatos de lectura en el sitio web de la revista, bien sea a través de la descarga tradicional o mediante el uso del Plugin para OJS incorporado a Marcalyc, de forma inmediata sin requerir la diagramación de un fascículo completo.
  • Por parte del formato ePUB, además de las características mencionadas, cabe destacar que están configurados de tal forma que sean aceptados por validadores internacionales, tales como EPUB Validator y EPUB 3.2 – W3C, sistemas que verifican la presencia de estándares internacionales para la elaboración de formatos ePUB.

    Entrada destacada

    Marcalyc | Versión 2.0.15

    Redalyc continúa mejorando la herramienta de marcación XML JATS #Marcalyc, ofrecida sin costo alguno a las casi 1,415 revistas científicas que indexa.

    De acuerdo a sus más recientes actualizaciones, hasta marzo de 2021, Marcalyc presenta las siguientes características:

    – Se agrega la posibilidad de que el usuario indique la paginación electrónica.

    – Se cambia la lógica en la decisión de usar el modelo de PDF Riga o Upsala, ahora se realiza para todos los números de la revista y no por artículo.

    – Se actualiza la generación del XML para SciELO al esquema v1.9.

    – En los productos de visualización para los artículos tipo reseña, no es obligatorio incluir la imagen de la portada.

    – Se permite desplazar y colapsar los grupos de referencias.

    – Se incrementó el límite del tamaño máximo del PDF original del artículo que se sube a Marcalyc.

    – Corregidos problemas en:

    • Descarga del archivo usado en la importación de los productos de la marcación al OJS.
    • La etiqueta <sc> (versalita) que en ocasiones se duplicaba.
    • Estilos en el visor, visor móvil y PDF.
    • La versión traducida de Marcalyc.
    • Traducción del contenido de las etiquetas XML.
    • Información en los productos.
    • La finalización de los números de publicación continua.
    • Iconos de las licencias Creative Commons que se visualizan en los visores.

    – Se agrega estilo en los encabezados de las tablas, tanto para los visores como en el XML.

    – Se realiza la validación para que en las referencias de tipo Revista (journal), sea obligatorio marcar el título del artículo (<article-title>).

    – En el XML de un artículo tipo reseña, se agrega el vínculo (<xref>) en la imagen de la portada.

    – Se realizan mejoras en la ventana del Asistente de Inferencia de las referencias.

    – Se corrigen fallas en el botón que permite eliminar una sección cuando se está creando o editando la información de un número.

    – En el XML se agrega la etiqueta para el título (<title>) en el agradecimiento (<ack>).

    – En el PDF se agrega el metadato que describe a la licencia Creative Commons.

    – Se separan las etiquetas para el Comentario y URL en la marcación de una referencia, de manera que en el XML se pueda separar el contenido.

    – Se corrigen fallas en la asignación de los enlaces externos en el elemento URL de la pestaña<referencias/apéndices/>.

    – En los visores se habilita la visualización de caracteres en Japonés.

    – Se actualiza la visualización de los datos principales de la revista en los visores.

    – En los visores se agrega la periodicidad de la revista.

    – En los visores se actualizan las rutas de los logos de la revista y de la institución que se visualizan en la cabecera y el logo de Redalyc en el pie de página.

    – En los visores se corrigen los enlaces hacia los otros productos de visualización.

    – En los PDF generados a partir de la marcación, se agrega la paginación, tanto para impresión como la electrónica.

    – En el HTML se ajusta el tamaño de los logos para que respete ciertas medidas estándar.

    – Se muestra el contenido completo de los resúmenes en la cortinilla del visor.

    – En el HTML descargable se agregan los logos de la identificación del autor (<contrid-id>), como por ejemplo el de ORCID.

    – Se actualiza la dirección URL para los identificadores tipo ORCID.

    – Se habilita la posibilidad de agregan estilos en la información del autor de correspondencia (<corresp>).

    – Se corrige la dimensión de la página del HTML descargable.

    – Se elimina la previsualización de las licencias Creative commons en el visor.

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    Optimizando los productos de visualización generados por Marcalyc

    Con la finalidad de mejorar los productos generados a partir del XML JATS obtenido de la marcación realizada con Marcalyc, se agregó la paginación a los PDF, ya sea para una versión impresa usando las etiquetas <fpage> y <lpage> o para la paginación electrónica usando la etiqueta <elocation-id>.

    Con esta mejora en los productos de visualización de los artículos científicos, se atiende una solicitud realizada por los editores de las revistas científicas indexadas en Redalyc.org, que generan sus PDF a partir de Marcalyc, ya que no es necesario que editen estos archivos para completar la información sobre la paginación que desean visualizar, además de hacer un uso más eficiente de los datos marcados.

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    Preguntas frecuentes Marcalyc

    1. ¿Cómo se genera el archivo index.html de cada artículo?

    Se puede generar usando el software Microsoft Word©, Adobe InDesign©, Adobe Illustrator© o cualquier otro que utilice la revista para generar la versión final de los artículos. Puede consultar el procedimiento detallado en la sección: 3. Preparación de los archivos para la marcación del Manual de usuario.

    2. ¿Qué debe contener el ZIP que se carga en el sistema?

    El ZIP debe contener la versión final del artículo en formato HTML, con codificación UTF-8, solo un archivo con el nombre index.html y un tamaño máximo de 4 MB. Además, se puede adjuntar la carpeta que contiene las imágenes del artículo, por ejemplo index_archivos o index_resources.

    3. ¿Cuál es el tamaño máximo de las imágenes?

    1 MB.

    4. ¿Puedo subir todas las imágenes a la vez o debe ser una por una?

    Marcalyc permite subir más de una imagen a la vez a la galería.

    5. ¿Se puede descargar el HTML que genera Marcalyc y usarlo en la plataforma OJS de la revista?

    Sí se puede descargar, como cualquier archivo HTML. Al hacerlo Marcalyc generará el nombre del documento HTML y una carpeta del mismo nombre. La forma de cargarlo a la plataforma OJS la determinará la configuración de la misma, la cual permite subir archivos de este tipo. También puede usar el plug-in de exportación de los productos de la marcación al OJS, el cual se activa al marcar todos los artículos del número.

    6. ¿Hay forma de automatizar el “enlace interno” de las citaciones con las referencias, para no hacerlo manualmente?

    Sí, usando el asistente de Inferencias de citas, el cual realiza los enlaces internos en las citas de las referencias, llamados a notas, tablas, figuras y ecuaciones. También se hace automáticamente el enlace externo en las direcciones URL, siempre y cuando usen el prefijo adecuado (http://, https://, entre otros).

    7. ¿Cuánto tiempo debo esperar desde que se marca completamente un número hasta que sale publicado en Redalyc con el nuevo home de la revista?

    El tiempo estimado para que Redalyc ponga en línea un número marcado es de 3 semanas aproximadamente. En este tiempo personal de Redalyc hará una revisión de la marcación y la actualización del acervo de la revista en el portal.

    8. ¿Se le puede asignar automáticamente el enlace al DOI del artículo?

    Si usted marcó una clave DOI, en el visor inteligente aparecerá su clave DOI con el vínculo correspondiente.

    9. ¿Por qué debo descargar los XML JATS4R? ¿Cuál es su importancia?

    El formato XML JATS4R puede considerarse como un documento de preservación digital de un artículo científico. Aparte de que permite ser enviado, garantizando su compatibilidad, a cualquier sistema científico de publicación que esté utilizando el estándar JATS, puede además ser considerado el archivo de respaldo por excelencia, ya que perdurará incluso más que un documento PDF, debido a que contiene el texto puro sin ningún estilo o formato que puede corromper el mismo, lo cual permitirá su visibilidad en el futuro con sólo generar alguna hoja de estilo que así lo permita.

    10. ¿La imagen destacada del artículo o cualquier otra imagen, puede ser un GIF animado?

    Sí es posible subir archivos GIF como imagen destacada del artículo. El único requisito es que sea su tamaño sea exactamente de 382×100 pixeles.

    11. ¿Para qué se usa el botón Información adicional de la pestaña <datos del artículo/>?

    Es una etiqueta que permite marcar información que no está considerada para ser contenida en alguna otra etiqueta. Por ejemplo, cuando se incluye información sobre cómo citar, sobre la clasificación JEL de un artículo de economía, etc.

    12. ¿Puede haber más de una “Información Adicional” en el artículo?

    Sí.

    13. ¿Cuál PDF va a publicar Redalyc, el generado por la revista o el que se genera a partir del XML JATS?

    El PDF que el editor decida que va a publicar, ya que Marcalyc permite subir el PDF de la revista o generar un PDF a partir de la marcación. Actualmente se tienen disponibles 2 plantillas: Riga y Upsala.

    14. ¿A qué números publicados por la revista es obligatorio generarle los XML JATS?

    Redalyc les pide a los editores el compromiso de generar los XML JATS de al menos los números publicados desde el 2016. A partir de enero de 2018, es obligatorio que las revistas migren al modelo de publicación basado en el XML JATS; ya sea que marquen usando Marcalyc o que envíen los XML JATS que la revista haya generando usando otras aplicaciones. En este último caso, el requisito es que dichos archivos pasen el validador del estándar JATS (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/xmlchecker/).

    15. ¿Cuántos niveles de secciones y subsecciones se pueden marcar usando Marcalyc?

    No hay límite, se pueden marcar tantos niveles de secciones tenga el artículo.

    16. ¿Cuántas afiliaciones se pueden marcar para un autor?

    No hay límite.

    17. ¿Siempre se debe editar el número que se va a marcar?

    Solo para aquellos números que ya estaban publicados en Redalyc. Y se editan una vez al iniciar su marcación.

    18. ¿Qué norma de citación debo seleccionar, si la que usa mi revista no aparece en la lista de valores?

    La recomendación es probar con las diferentes normas de citación de la lista, buscando aquella que más se asemeje en la forma de presentar los nombres de los autores y el año de cada referencia, ya que esto le permite a Marcalyc inferir estos datos y por lo tanto se reduce el tiempo de marcación. Si selecciona la opción NINGUNO, deberá separar y marcar manualmente cada una de las referencias.

    19. ¿Es obligatorio utilizar el asistente de inferencias de Marcalyc?

    No. En la versión actual de Marcalyc se permite realizar la marcación sin usar el asistente de inferencias. Aunque la recomendación es usar dicho asistente ya que se disminuye considerablemente el tiempo de marcación.

    20. ¿El asistente de inferencias para marcar las referencias del artículo sólo trabaja para la norma APA?

    No. Se puede utilizar el asistente de inferencias para cualquier otra norma de citación, sólo que la inferencia se hace mucho mejor para la norma APA, en futuras actualizaciones de dicho asistente se irán incluyendo otras normas de citación.

    21. ¿Qué debo hacer si agregué un artículo de la revista más de una vez?

    Deberá usar la opción Eliminar que se encuentra del lado derecho del título del artículo a borrar.

    22. ¿La información inferida automáticamente por Marcalyc se puede modificar?

    Sí. La recomendación general es revisar cuidadosamente toda la información inferida por Marcalyc y en caso de existir algún error, debe ser corregido.

    23. ¿Las imágenes destacadas de los artículos deben obligatoriamente ser imágenes del artículo?

    No precisamente, puede ser cualquier imagen relacionada al artículo. Se sugiere que sean imágenes a color.

    24. ¿Se pueden agregar otros fechas del proceso de publicación además de la de recibido y aceptado?

    Sí, puede agregar todas las fechas que sean necesarias al activar o seleccionar el cuadro Fechas y usar el botón Fecha que se encuentra en la Barra de etiquetas y atributos.

    25. Al marcar una lista ¿se debe agregar elemento por elemento?

    No. Del lado izquierdo de Marcalyc, debe seleccionar el cuadro Lista y del lado derecho debe seleccionar la lista completa incluyendo los identificadores de cada elemento, ya sean números, viñetas, letras, entre otros. Marcalyc separará cada elemento e identificará el tipo de lista, como siempre, debe verificar que sea correcta la marcación realizada.

    Constante capacitación a cuerpos editoriales de revistas Redalyc

    Una de las actividades que de manera ininterrumpida se llevan a cabo en Redalyc son las capacitaciones, presenciales o virtuales, a editores de revistas científicas en el uso de la herramienta de marcación XML JATS Marcalyc.

    A lo largo de 2019 se realizaron 69 capacitaciones personalizadas en línea y 10 capacitaciones masivas, además de 3 capacitaciones presenciales donde se instruyó a 260 personas, de 171 revistas pertenecientes a 21 países de todo el mundo.

    En los espacios de capacitación se orienta a los miembros de cada revista en el proceso de marcación XML JATS de sus artículos en el sistema Marcalyc que recientemente ha integrado dos nuevas herramientas que optimizan aún más la labor editorial: el software para la importación/exportación de Marcalyc-AmeliCA XML al OJS, un desarrollo de Redalyc y AmeliCA y el Asistente de Inferencias Marcalyc: Marcación XML JATS automática.

    El software para la importación/exportación de Marcalyc/AmeliCA XML al OJS permite, a partir de la marcación XML, generar automáticamente los archivos PDF, ePUB, HTML y exportarlos con un par de clics al OJS, reduciendo costos y tiempos para sostener las revistas de Acceso Abierto sin APC. Por su parte, el Asistente de Inferencias Marcalyc optimiza el proceso de marcación XML de los artículos de cada revista, lo que se traduce en un ahorro importante en recursos humanos y económicos para los cuerpos editoriales, condición que favorece la transición integral de las revistas hacia la era digital, además de fomentar un ecosistema de comunicación no comercial, sustentable y manos de la academia.

    Estos dos últimos desarrollos para Marcalyc, aunados a la constante capacitación y acercamiento con los cuerpos editoriales de revistas Redalyc, mantiene un espacio de comunicación abierto y dinámico, apostando por la profesionalización de los editores al dotarles, sin costo, de tecnología de punta que optimiza su labor, a la vez que las revistas alcanzan los más altos estándares de calidad.

    Marcalyc, una vez finalizado el proceso de marcación XML JATS, genera diversos soportes de lectura, tales como Visor Inteligente, Visor Móvil de Artículos, ePub, HTML y PDF. Los formatos descargables: ePub, HTML y PDF pueden ser colocados en los sitios web de cada revista.

    Si usted es editor de una revista indizada en Redalyc y ya tiene una cuenta de #Marcalyc, puede capacitarse solicitando el registro a través de editores@redalyc.org ¡Con gusto le atenderemos!

    Todo esto tiene como objetivo conservar el ecosistema de Acceso Abierto sin fines lucro y propiedad de la academia.

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    Editores Redalyc constantemente capacitados en Marcalyc

    Desde su lanzamiento, en septiembre de 2016, la herramienta de marcación XML JATS Marcalyc, se ha capacitado, de forma presencial o virtual, a las y los editores Redalyc que han solicitado su cuenta de acceso a este sistema.

    Hasta febrero del 2019, se han llevado a cabo un total de 298 capacitaciones personalizadas en línea a los cuerpos editoriales que las solicitan.

    Las capacitaciones personalizadas en línea son una excelente herramienta para las y los editores, sobre todo en aquellos casos en los que el aspecto geográfico les impide participar en las sesiones presenciales que al menos dos veces al año se imparten en el edificio Redalyc.

    A lo largo de las entre dos y tres horas dedicadas a los editores, se les acompaña en el proceso de marcación de un artículo de sus revistas. Este ejercicio se contempla también como parte de la constante asesoría que Redalyc ofrece a las revistas científicas que indexa.

    La respuesta de los cuerpos editoriales ha sido magnífica. Países como Brasil, Colombia, Argentina, Perú, Chile, México, Costa Rica, Panamá y Venezuela, solicitan diariamente ejercicios de capacitación personalizada en el uso de Marcalyc.

    Capacitaciones a editores iberoamericanos en el uso de Marcalyc

    Las capacitaciones a editores Redalyc que ya usan o desean comenzar a usar la herramienta de marcación XML JATS #Marcalyc, se han mantenido constantes desde su lanzamiento en septiembre del año 2016.

    Diariamente se ofrece un espacio de dos a tres horas para que se atienda de manera personalizada y en línea, a miembros de diversos cuerpos editoriales con el fin de mejorar y aprovechar al máximo este sistema de marcación de artículos científicos.

    Marcalyc, una vez finalizado el proceso de marcación XML JATS, genera diversos soportes de lectura, tales como Visor Inteligente, Visor Móvil de Artículos, ePub, HTML y PDF. Los formatos descargables: ePub, HTML y PDF pueden ser colocados en los sitios web de cada revista.

    Si eres editor de una revista indizada en Redalyc y ya tiene una cuenta de #Marcalyc, puede capacitarse solicitando el registro a través de editores@redalyc.org ¡Con gusto te atenderemos!

    Marcalyc | Versión 2.0.14

     

    Redalyc continúa mejorando la herramienta de marcación XML JATS #Marcalyc, ofrecida sin costo alguno a las casi 1,300 revistas científicas que indexa.

    La más reciente actualización, lanzada en febrero de este año, presenta las siguientes actualizaciones:

    • En el visor se integran todas las fechas del proceso de evaluación que incluya el usuario.
    • En la plantilla del marcador, aparecen siempre las fechas de recibido y aceptado del artículo, para ayudar a que sea un dato importante que el usuario marque.
    • Se realiza una validación para impedir que el usuario finalice la marcación sin que haya marcado al menos una sección del body.

    Para obtener más información, visite: http://marcalyc.redalyc.org/ayuda/

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    Primera sesión de 2017 sobre la implementación de XML JATS

    Webinar_Abril6

     

    El 6 de abril se efectuó la sesión web denominada “¿Tu revista aún no implementa XML JATS? Conoce lo que Redalyc te ofrece”, la cual estuvo dirigida a las revistas que aún no han implementado XML JATS y a aquéllas que ya lo utilizan, pero tienen dudas en relación con este estándar. Dicha sesión web contó con la participación de 168 personas de 118 instituciones de 13 países, y estuvo a cargo de la doctora Arianna Becerril García, Directora de Tecnología e Innovación de Redalyc.

    En la sesión se mencionó que en la actual era de la información es necesario contar con datos más “inteligentes”, es decir, más fáciles de encontrar, procesar y acceder por máquinas. A modo de introducción, se describió qué es un XML, así como la importancia de su uso, y se explicó que el Journal Article Tag Suite (JATS) se trata de un estándar técnico, una iniciativa que define un formato XML para describir estructura, semántica y metadatos para contenido digital científico.

    Arianna Becerril señaló que Redalyc garantiza que el XML JATS generado por su sistema de marcación (Marcalyc) es interoperable y compatible con el estándar JATS y la iniciativa JATS4R, y que dicho sistema de información científica busca, entre otras cosas, eliminar las barreras de interoperabilidad y garantizar que los archivos en los que se preserva el contenido científico de las revistas puedan ser reutilizados por otras plataformas.

    Agregó que para tener éxito en cuanto al tema de la interoperabilidad es necesario maximizar los acuerdos entre los diferentes actores. También hizo hincapié en que la estrategia de Redalyc para la adopción del estándar XML JATS se basa en dos principios, a saber: la profesionalización de los editores y la reutilización de los archivos. Sobre este último punto, indicó que Redalyc acepta los archivos XML generados por otras plataformas, entre las que se encuentra SciELO, siempre y cuando estén elaborados con base en el estándar JATS. Aclaró que si una revista está indizada en Redalyc y en SciELO no debería ser necesario que se realice la marcación dos veces.

    En la parte final de la sesión se explicó el uso de la herramienta Marcalyc, desde la preparación del archivo para la marcación, pasando por la marcación de cada una de las secciones de un documento (front, body y back) hasta llegar a la generación del XML y sus productos (visor inteligente, visor móvil, ePUB, PDF, HTML, XML JATS4R y XML SciELO).

    Se explicó que existen dos alternativas para la adopción de XML JATS en Redalyc: el envío a dicho sistema de información de un XML JATS válido (puede ser marcado con otras herramientas) y la marcación con Marcalyc.

    Finalmente, se señaló que Redalyc está dispuesto a abrir Marcalyc a revistas indizadas en SciELO aunque no formen parte del acervo de Redalyc, con objeto de que para éstas no sea un factor de exclusión el no contar con recursos y tecnología para marcar en el estándar XML JATS.

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