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XML JATS en Redalyc

Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas.

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JATS4R

Capacitaciones a editores iberoamericanos en el uso de Marcalyc

Las capacitaciones a editores Redalyc que ya usan o desean comenzar a usar la herramienta de marcación XML JATS #Marcalyc, se han mantenido constantes desde su lanzamiento en septiembre del año 2016.

Diariamente se ofrece un espacio de dos a tres horas para que se atienda de manera personalizada y en línea, a miembros de diversos cuerpos editoriales con el fin de mejorar y aprovechar al máximo este sistema de marcación de artículos científicos.

Marcalyc, una vez finalizado el proceso de marcación XML JATS, genera diversos soportes de lectura, tales como Visor Inteligente, Visor Móvil de Artículos, ePub, HTML y PDF. Los formatos descargables: ePub, HTML y PDF pueden ser colocados en los sitios web de cada revista.

Si eres editor de una revista indizada en Redalyc y ya tiene una cuenta de #Marcalyc, puede capacitarse solicitando el registro a través de editores@redalyc.org ¡Con gusto te atenderemos!

Entrada destacada

Redalyc continúa innovando con la herramienta de marcación XML JATS Marcalyc

infografia_marcalycb-02Redalyc continúa innovando con Marcalyc.

El 10 enero de este año se liberó la versión 1.1 que recupera las características de versiones anteriores, y añade nuevas, mejorando la experiencia de marcación para los editores de revistas científicas de acceso abierto.

Entre las nuevas características de la versión 1.1 de Marcalyc, se encuentra el reconocimiento automático de 12 diferentes formatos de citación: APA, AMA, CHICAGO, HARVARD, MLA , VANCOUVER, ASA, IEEE, ABNT, ISO 690 y 690-2 (versión 2007) y NLM.

La versión 1.1 de Marcalyc permite a los editores personalizar sus artículos con una imagen de portada que será visible en la tabla de contenido de cada número. De esta forma se ilustra el contenido del artículo.

Con la finalidad de hacer aún más amigable y sencillo el uso de esta herramienta de marcación, Redalyc ha creado un nuevo sitio de apoyo didáctico a los editores: Marcalyc Ayuda (marcalyc.redalyc.org/ayuda/). Este sitio cuenta con videotutoriales, el manual de usuario de Marcalyc, videos del curso de certificación y un apartado de preguntas frecuentes, además de una recopilación de las características de las versiones anteriores de Marcalyc.

Desde el sitio de apoyo es posible vincularse al blog xmljtasredalyc.org, conocer las vías de soporte en línea y conectarse con las redes sociales de Redalyc.

Marcalyc Ayuda refuerza las capacitaciones personalizadas a editores que se han llevado a cabo desde el pasado septiembre.

Marcalyc, liberada el 1 de septiembre de 2016, es una herramienta de marcación XML JATS, servicio gratuito para los editores de revistas indizadas en redalyc.org. Además, es compatible con la recomendación JATS4R.

Redalyc prevé la adhesión de nuevas características a esta herramienta para versiones futuras.

Redalyc 3.0. Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas 

Segundo Curso de certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: marcación XML JATS

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El 24 de noviembre se efectuó la primera sesión del segundo curso web de certificación XML JATS impartido por Redalyc, durante la cual Arianna Becerril y Salvador Chávez, Directora de Tecnología e Innovación y Director de Documentación y Contenido de Redalyc, respectivamente, describieron los antecedentes y conceptos básicos del meta-lenguaje XML y explicaron la importancia de su uso, la estructura de un archivo JATS, su interoperabilidad, el orden del proceso de marcación, las ventajas del estándar XML JATS y el desarrollo de la herramienta Marcalyc por parte del Sistema de Información Científica Redalyc.

En dicha sesión se hizo referencia a los productos derivados de la marcación con Marcalyc, a saber: el visor inteligente, un visor móvil, los formatos ePUB, PDF, HTML, XML JATS4r y XML SciELO, así como el nuevo home de revistas en Redalyc; y se detallaron las alternativas de adopción del XML JATS en dicho sistema de información.

Durante la sesión y en la parte final de ésta se respondieron las preguntas formuladas por los participantes, las cuales versaron principalmente sobre la compatibilidad de los XML JATS manejados por SciELO y Redalyc, la interacción entre OJS y XML JATS y los estilos de citación que reconoce la herramienta Marcalyc.

En la sesión participaron 168 personas adscritas a 107 instituciones de 14 países. El curso concluirá mañana con una sesión práctica sobre el uso de Marcalyc.

Manual de usuario Marcalyc

Estimado editor, ponemos a su alcance el Manual de usuario Marcalyc, tecnología Redalyc, con el fin de facilitar su uso en este sistema de marcación XML-JATS.

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Agosto 18, 2016: 3ª sesión del Curso de Certificación en XML JATS

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En la tercera sesión del Curso de Certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS, celebrada el 18 de agosto, se efectuó un análisis pormenorizado del Marcalyc, la herramienta de marcación generada por Redalyc, con objeto de que las 675personas (de 21 países) que se conectaron a la sesión web se familiarizaran con los módulos, secciones, atributos y etiquetas que componen este sistema y conocieran, paso a paso, el procedimiento para efectuar la marcación de un artículo.

 

Previo a la explicación gráfica del funcionamiento del Marcalyc, la doctora Arianna Becerril, Directora de Tecnología e Innovación de Redalyc, anunció que la versión beta de dicha herramienta se liberará el 1° de septiembre y precisó que ese lanzamiento es el resultado del trabajo realizado durante un año por un equipo de aproximadamente 20 personas, entre las que se encuentran Fernando Rodríguez, Coordinador del Índice de Revistas Venezolanas, Revencyt, de la Universidad de Los Andes, Venezuela y la maestra Eliana Guzmán, profesora de dicha universidad. Agregó que Marcalyc, que funciona en un ambiente web, proporciona una forma de marcar artículos bastante sencilla y reiteró que el uso de esta herramienta no demanda conocimientos técnicos, ya que quien realice el proceso no necesita conocer las más de 260 etiquetas que se encuentran ͞entre bastidores.

 

La doctora Becerril comentó que la marcación de las referencias es la tarea más laboriosa, por lo que hizo hincapié en la necesidad de que las revistas observen cabalmente las normas de citación que adopten, a fin de facilitar este proceso. Dicho lo anterior, Fernando Rodríguez explicó el funcionamiento de Marcalyc, para lo cual utilizó un artículo de la revista Diversitas: Perspectivas en Psicología, de la Universidad Santo Tomás, Colombia, dado que ésta observa un adecuado proceso de citación con base en el formato APA, lo que le permitió al sistema efectuar un proceso de inferencia adecuado.

 

En esta sesión se reiteró que la marcación debe observar una secuencia lógica (primero se trabaja el front, posteriormente el back y finalmente el body), a fin de posibilitar los enlaces a las referencias y a otras secciones marcadas previamente y que, a su vez, esta vinculación de elementos permite que al final del proceso se efectúe una lectura interactiva de un artículo científico, ya sea en una computadora o en un dispositivo móvil. Se explicó que para marcar los elementos de un artículo sólo se debe efectuar una operación simple: seleccionar-soltar, ya que el sistema trasladará el elemento seleccionado a la caja correspondiente. De modo gráfico, se mostró cómo marcar párrafos normales, citas textuales, así como la forma de insertar figuras, gráficos, tablas, ecuaciones y listados, y se aclaró que el sistema permite verificar si se cometieron errores u omisiones durante el proceso.

 

Al terminar la marcación del artículo seleccionado se ejemplificó la experiencia de lectura que permite el visor inteligente y se mostraron los diversos formatos de salida obtenidos (XML, ePub, HTML y PDF). Finalmente, se atendieron algunas preguntas formuladas por los participantes y se recordó que en la cuarta y última sesión del curso se abordarán temas como la comparación de  con las herramientas de otras plataformas, en cuanto a tiempos y costos, y las condiciones establecidas para que los editores puedan utilizar esta herramienta.

Agosto 10, 2016: 2ª sesión del Curso de Certificación en XML JATS

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El 10 de agosto se efectuó la segunda sesión del Curso de Certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS, la cual se enfocó a explicar qué es y qué no es un XML JATS y a detallar sus antecedentes y ventajas.

Dicha sesión web contó con la participación de 670 personas de 24 países, lo que revela el interés de los editores por adquirir conocimientos sobre esta herramienta. Esta sesión estuvo a cargo de Arianna Becerril García, Directora de Tecnología e Innovación, y de Salvador Chávez Ávila, Director de Documentación y Contenido de Redalyc, quienes, a modo de introducción, analizaron la evolución de la web y de las tecnologías que permiten la comunicación científica, así como el uso de datos inteligentes, para pasar a ubicar al XML en su contexto.

Al respecto, la Dra. Arianna Becerril señaló que la pregunta pertinente en este momento no es si se debe o no migrar hacia el XML sino cómo efectuar dicha migración de la forma más rápida y con el menor costo posible, a fin de recuperar el tiempo perdido y explotar al máximo las ventajas del etiquetado XML en los sitios web de las revistas.

Posteriormente se detallaron las partes o secciones que componen el estándar JATS (front, body y back) y se señaló que Redalyc garantiza que el XML JATS generado por su sistema de marcación (Marcalyc) es interoperable y compatible con el estándar JATS y JATS4R, y que dicho sistema de información científica busca eliminar las barreras para que los archivos en los que ser preserva el contenido científico de las revistas puedan ser reutilizados por otras plataformas.

Finalmente, se respondieron preguntas de los participantes sobre temas como el porcentaje de homologación de las herramientas de marcación de Scielo y Redalyc, los límites de la creación de etiquetas, la reutilización de archivos utilizados por otras plataformas, la marcación de fórmulas matemáticas y las formas de visualización en OJS.

Preguntas frecuentes

  1. ¿Cómo se genera el archivo index.html de cada artículo?

R: Se puede generar usando el software Microsoft Word, Adobe InDesign, Adobe Illustrator o cualquier otro que utilice la revista para generar la versión final de los artículos. Puede consultar el procedimiento detallado en la sección: 3. Preparación de los archivos para la marcación del Manual de usuario.

2. ¿Qué debe contener el ZIP que se carga en el sistema?

R: El ZIP debe contener la versión final del artículo en formato HTML, con codificación UTF-8, solo un archivo con el nombre index.html y un tamaño máximo de 4 MB. Además, se puede adjuntar la carpeta que contiene las imágenes del artículo, por ejemplo index_archivos o index_resources.

3. ¿Cuál es el tamaño máximo de las imágenes?

R: 1MB

4. ¿Puedo subir todas las imágenes a la vez o debe ser una por una?

R:  Marcalyc permite que se suba más de una imagen a la vez a la galería.

5. ¿Se puede descargar el HTML que genera Marcalyc y colocarlo en la plataforma OJS de la revista?

R:  Sí se puede descargar, como cualquier archivo HTML. Al hacerlo Marcalyc generará el nombre del documento HTML y una carpeta del mismo nombre. La forma de cargarlo a la plataforma OJS la determinará la configuración de la misma, la cual permite subir archivos de este tipo.

6. ¿Hay forma de automatizar el “enlace interno” de las citaciones con las referencias, para no hacerlo manualmente?

R: Actualmente no es posible, pero ya se encuentra en estado de pruebas una versión de Marcalyc que posee dicha funcionalidad.

7. ¿Cuánto tiempo debo esperar desde que se marca completamente un número hasta que sale publicado en Redalyc con el nuevo home de la revista?

R: El tiempo estimado para que Redalyc ponga en línea un número marcado será de 3 semanas aproximadamente. En este tiempo personal de Redalyc hará una revisión y actualización del acervo de su revista en el portal.

8. ¿Se le puede asignar automáticamente el enlace al DOI del artículo?

R: Si usted marcó una clave DOI, en el visor inteligente aparecerá su clave DOI con el vínculo correspondiente.

9. ¿Por qué debo descargar los XML JATS4R? ¿Cuál es su importancia?

R: El formato XML JATS4R puede considerarse como un documento de preservación digital de un artículo científico. Aparte de que permite ser enviado, garantizando su compatibilidad, a cualquier sistema científico de publicación que esté utilizando el estándar JATS, puede además ser considerado el archivo de respaldo por excelencia, ya que perdurará incluso más que un documento PDF, debido a que contiene el texto puro sin ningún estilo o formato que puede corromper el mismo, lo cual permitirá su visibilidad en el futuro con sólo generar alguna hoja de estilo que así lo permita.

10. ¿La imagen destacada del artículo o cualquier otra imagen, puede ser un GIF animado?

R: A partir de la versión 1.0 estable de Marcalyc si es posible subir imágenes GIF como imagen destacada del artículo. El único requisito es que sea su tamaño sea exactamente de 382×100 pixeles.

11. ¿Para qué se usa el botón Información adicional de la pestaña <datos del artículo/>?

R:  Es una etiqueta que permite identificar información que no está considerada para ser contenida en alguna otra etiqueta. Por ejemplo, cuando se incluye información sobre cómo citar, sobre la clasificación JEL de un artículo de economía, etc.

12. ¿Puede haber más de una “Información Adicional” del artículo?ATS?

R: Sí

13. ¿Cuál PDF va a publicar Redalyc, el generado por la revista o el que se genera a partir del XML JATS?

R: El PDF que el editor decida que va a publicar, ya que Marcalyc permite subir el PDF de la revista o generar un PDF a partir de la marcación. Actualmente se tienen disponibles 2 plantillas: Riga y Upsala.

14. ¿A qué números publicados por la revista es obligatorio generarle los XML JATS?

R: Redalyc les pide a los editores el compromiso de generar los XML JATS de al menos los números publicados durante el 2016 y 2017. A partir de enero de 2018, es obligatorio que las revistas migren al modelo de publicación basado en el XML JATS; ya sea que marquen usando Marcalyc o que envíen los XML JATS que la revista haya generando usando otras aplicaciones. En este último caso, el requisito es que dichos archivos pasen el validador del estándar JATS (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/xmlchecker/).

15. ¿Cuántos niveles de secciones y subsecciones se pueden marcar usando Marcalyc?

R:  No hay límite, se pueden marcar tantos niveles de secciones tenga el artículo.

16. ¿Cuántas afiliaciones se pueden marcar para un autor?

R: No hay límite.

17. ¿Siempre se debe editar el número que se va a marcar?

R: Solo para aquellos números que ya estaban publicados en Redalyc. Y solo se editan una vez al iniciar su marcado.

18. ¿Qué norma de citación debo seleccionar, si la que usa mi revista no aparece en la lista de valores?

R: La recomendación es probar con las diferentes normas de citación de la lista, buscando aquella que más se asemeje en la forma de presentar los nombres de los autores y el año de cada referencia, ya que esto le permite a Marcalyc inferir estos datos y por lo tanto se reduce el tiempo de marcación. Si selecciona la opción de NINGUNO, deberá separar y marcar manualmente cada una de las referencias.

19. ¿Qué debo hacer si agregué un artículo de la revista más de una vez?

R: Deberá usar la opción de Eliminar que se encuentra del lado derecho del título del artículo a borrar.

20. ¿Las imágenes destacadas de los artículos deben obligatoriamente ser imágenes del artículo?

R: No precisamente, puede ser cualquier imagen relacionada al artículo. Se sugiere que sean imágenes a color.

Entrada destacada

El nuevo modelo de publicación ALyC: XML JATS

Captura de pantalla 2016-08-12 a las 18.03.33Conectando al Sur con la ciencia global. El nuevo modelo de publicación
en ALyC, no comercial, colaborativo y sustentable.

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Recomendaciones del JATS4R

Se sabe que el estándar JATS permite que un mismo contenido pueda ser marcado de diferentes maneras, siendo todas válidas, lo que dificulta la interoperabilidad perfecta. Por tal motivo, los propósitos de las recomendaciones del JAT4R son:

  • Hacer reusable las partes claves de un archivo XML JATS para que las computadoras, y también las personas, puedan procesar, intercambiar, almacenar y recuperar eficientemente el contenido de los artículos científicos.
  • Minimizar las barreras para que los contenidos sean reusados por los sistemas que los publican, tales como plataformas, bibliotecas, repositorios, agregadores y catálogos digitales.

Las recomendaciones actuales del JATS4R se centran en el uso de las etiquetas para la marcación de algunas partes específicas de los archivos XML JATS (http://jats4r.org/recommendations/), tales como:

  1. Recomendaciones generales: para la configuración general del archivo XML, específicamente en la declaración de la DTD, DOCTYPE, ?XML-MODEL y codificación de caracteres.
  2. Referencias: recomendaciones sobre el uso de etiquetas en la marcación de las referencias. Vale la pena mencionar que sólo se recomienda el uso de dos tipos de referencias, revista (journal) y libro (book). No se recomienda usar el tipo “otro” (other).
  3. Referencia de un conjunto de datos (Data citations): cuando se contempla el uso de este tipo de referencia, se hacen recomendaciones sobre la forma de marcarla, las cuales incluyen: el tipo de autor, el tipo de referencia, la forma de marcar el año, versión de los datos, entre otras.
  4. Marcación de fórmulas o ecuaciones (Math): se recomienda marcar las ecuaciones o fórmulas de forma detallada usando las etiquetas <text-math> o <mml:math>, además de incluir la imagen usando la etiqueta <graphic>. No se deben marcar sólo como imagen.
  5. Permisos: recomendaciones sobre el uso de las licencias y copyright en el artículo completo o en partes del artículo, como por ejemplo las figuras. Cuando se usa una licencia Creative Commons se recomienda incluir el URI completo de la licencia, como por ejemplo <license xlink:href=”https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ ” >.

Para verificar el cumplimiento de las recomendaciones del JATS4R, se debe usar el validador que está disponible en su página web (http://jats4r.org/validator/).

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