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XML JATS en Redalyc

Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas.

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jats

Preguntas frecuentes

preguntas 1-01

 

  1.  En el caso de las revistas cuyos artículos se encuentran marcados con XML mediante la indización en las plataformas SciELO o e-Pub, ¿quién será responsable por someterlos a validación?

R: Siempre y cuando sean XML JATS no hace falta realizar ninguna verificación, pues se adaptarán a la plataforma de Redalyc inmediatamente. Cabe aclarar que actualmente sólo SciELO Brasil, SciELO Costa Rica y SciELO México están implementando este estándar, y lo están haciendo con los números publicados de 2015 en adelante. Los XML que se pueden descargar desde los demás sitios SciELO o desde los mencionados, de años anteriores no son XML JATS, por lo que no son compatibles con el estándar asumido.

 

  1. ¿Si estamos en esta plataforma, ya no es necesario utilizar OJS?

R: El Open Journal System (OJS) se concibió como un gestor de los procesos editoriales, que en muchos casos está sirviendo de plataforma de publicación de las revistas con muy buenas prestaciones. La marcación en XML JATS y los productos que de ésta se generan serán implementados en primer lugar en el home de la revista en Redalyc, pero el editor podrá descargarlos y hacer uso de ellos como considere. En el momento en que se puedan implementar en OJS lo podrá hacer directamente (esto dependerá de las actualizaciones del OJS). En ningún caso lo generado con la marcación del XML JATS suplantará los procesos editoriales que administra con OJS.

 

  1. Si contamos con un formato PDF, ¿es necesario que se tenga otro formato en esta nueva etapa?

R: La marcación de artículos científicos utilizando el estándar XML JATS permite la modificación del modelo de publicación, el cual ofrece la posibilidad de generar a partir de ésta los productos de publicación y visibilidad de la revista (PDF, HTML, visor inteligente, ePub). Si se ve como un formato de publicación adicional, no implica en ningún caso un cambio obligatorio, pero no permitiría el aprovechamiento de los recursos tecnológicos que este nuevo proceso favorece. En Redalyc, la implementación de un nuevo home de la revista y la generación de productos derivados sólo se hará a partir de los números de revista marcados bajo XML JATS.

 

  1. ¿El marcado que enviamos a PubMed Central va a servir sin modificaciones adicionales para vuestra plataforma cuando implementéis el XML?

R: Si el XML fue marcado con etiquetas JATS, servirá perfectamente. Sin embargo, para salir de dudas recomendamos remitir a Redalyc un archivo XML del que ya envían a PubMed, a fin de realizar la verificación.

 

  1. ¿Es necesario utilizar un plugin adicional para generar los XML JATS, para las revistas que están en la plataforma OJS?

R: Los desarrolladores de Public Knowledge Project – PKP, creadores del OJS, están realizando su propia herramienta de marcación XML JATS. Hasta el momento no se cuenta con información sobre su integración con la plataforma de OJS. A la fecha no existe este plugin.

 

  1. ¿Por qué no se considerarán a las revistas que cobran APC’S?

R: La filosofía de Redalyc sobre el acceso abierto es muy clara. Los desarrollos tecnológicos y científicos generados con recursos públicos deben ser aprovechados por todos, de forma totalmente gratuita. Redalyc ha desarrollado una herramienta tecnológica para que sea aprovechada por su comunidad de editores y autores colaboradores de las revistas. ¿Por qué entregarle gratuitamente una herramienta a una revista que generará sus productos a través de ésta y cobrará a sus autores por su publicación? En América Latina no existe la tradición de que las revistas científicas cobren a sus colaboradores. Redalyc trabaja en función de una comunidad que cuide y proteja el acceso abierto.

 

  1. ¿La marcación de Redalyc impide o restringe la participación en las marcaciones que tienen otros sistemas, como SciELO?

R: No la impide, ya que los XML JATS generados por los dos sistemas son compatibles. Es una opción que se le ofrece al editor, sobre todo porque la marcación en XML JATS dentro de las redes SciELO sólo se está efectuando en Brasil, México y Costa Rica.

 

  1. ¿La identidad de la revista se conservará con la marcación XML JATS?

R: La marcación XML JATS es un estándar y los productos que de ésta se deriven podrán ser personalizados por cada revista dependiendo de la programación que se realice para tal fin. En el caso del visor de los artículos marcados, de los PDF Redalyc y de los ePub, se hará con una salida estándar por la imposibilidad de realizar una personalización a cada una de las 1,138 revistas indizadas en Redalyc. Si el editor desea personalizar sus formatos de salida en la plataforma Redalyc, puede realizar sus propias hojas de estilo y desarrollos para tal fin o ponerse en contacto con Redalyc para definir una estrategia que permita esta personalización.

 

  1. ¿Por qué seguir usando formatos ePub cuando los dispositivos móviles ya soportan otros formatos?

R: La adaptabilidad de un documento (PDF, por ejemplo) para ser leído en un dispositivo móvil, en algunos casos depende de la aplicación con la que fue creado, o incluso de la aplicación con la que se está leyendo en el dispositivo. Los ePub garantizan su legibilidad y mejor manejo, pues son creados especialmente para ello. En todo caso, es un producto adicional que se le ofrece a los editores de las revistas y al usuario en general.

 

  1. ¿La marcación (XML JATS) que se realizará en los artículos a partir del Marcalyc podrá colgarse en las plataformas OJS?

R: Actualmente el OJS sólo permite la descarga de otros formatos y la lectura en formato HTML tradicional del documento según su configuración. Si se “colgara” un documento XML JATS en su plataforma OJS, el usuario sólo podría descargarlo pero no visualizar su contenido con ningún otro formato. La visualización con un visor inteligente requiere un desarrollo propio integrado para la plataforma que aún no se lleva a cabo por parte del equipo desarrollador del OJS.

 

  1. ¿Cuál es el tiempo de vida de los XML JATS?¿Cuál es la razón de usar XML JATS?

R: Es difícil determinar su vida útil, pero aunque el JATS deje de ser un estándar dentro de unos años (pues su adopción ha sido reciente y con una importante receptividad por los más relevantes sistemas metaeditoriales), la garantía de preservación la otorga el formato XML, que con el paso del tiempo siempre podrá ser adaptado a nuevas metodologías.

 

  1. ¿SciELO aceptará los XML JATS de Redalyc y Redalyc aceptará los XML JATS de SciELO?

R: Los dos sistemas asumen el XML JATS como el estándar de marcación de documentos científicos y los dos colaboran con JATS4R con la finalidad de optimizar el uso de los documentos marcados con este estándar, por lo que se asume que, a pesar de que para ser 100% compatibles haya que realizar una leve adaptación a los archivos -por poseer datos propios de cada sistema-, funciona perfectamente para los dos sistemas. Por lo tanto, Redalyc sí aceptará los XML JATS marcados para SciELO.

 

  1. ¿Cuáles serían los requisitos que deben cumplir las revistas para poder trabajar con la herramienta de marcación Marcalyc y generar los XML JATS?

R: Las revistas deben, en un principio, estar indizadas en Redalyc; ser de acceso abierto; no aplicar la política de APC’s (Cargo por Procesamiento de Artículos, APC por sus siglas en inglés) y haber participado en las cuatro sesiones del webinar de capacitación dictado por Redalyc para obtener la certificación respectiva. El uso de esta herramienta no implica ningún costo para el usuario; es completamente gratuita.

 

  1. Los XML podrán ser usados para otras plataformas como SciELO?

R: Efectivamente, el uso del estándar JATS para la generación del XML y el uso por ambas plataformas (Redalyc y SciELO) de las recomendaciones establecidas por la iniciativa de reutilización del JATS for Reuse (JATS4R) permiten este intercambio sin manipulación adicional por parte del usuario. Por ello, Redalyc desarrolló una exportación automática de sus XML JATS para su uso en SciELO.

 

    15. ¿El editor tendrá parte activa en la marcación de los textos en un trabajo conjunto con Marcalyc o el proceso de marcación en su totalidad será realizado por Marcalyc?

R:Marcalyc es la herramienta desarrollada por Redalyc para que el editor pueda marcar sus archivos en formato XML JATS. Si decide utilizarlo, se le dará una clave de acceso.

 

  1. ¿No tendría valor o importancia la estética de las versiones digitales de las revistas? Pues, si se ilustra, diagrama, etc. las plataformas que sostienen las revistas no soportan el peso de las mismas? ¿Cómo fortalecer este aspecto?

R: La intención del XML es rescatar incluso la estética de las versiones digitales; hablaremos más de este tema en las siguientes dos sesiones.

 

  1. ¿Es posible en la plataforma tener una vista previa antes de publicar, como un tipo borrador?

R: Sí es posible tener una vista previa. El sistema, al finalizar el proceso de marcación satisfactoriamente, permitirá al usuario ver el resultado en un visor inteligente, en formato PDF, en HTML, en ePUB, generados automáticamente a partir de su marcación. En caso de querer realizar algún cambio, podrá acceder al Marcalyc nuevamente, editarlo y generar de nuevo, de forma automática, los productos de visualización de su marcación. Éstos podrán ser descargados inmediatamente por el usuario.

 

  1. ¿Las nuevas revistas que estén postulando a Redalyc tendrán que adoptar desde ya estas politicas de XML JATS?

R: No, Redalyc tiene como estrategia desarrollar esta evolución de su plataforma de forma paulatina y flexible, a medida de las posibilidades de las revistas, pero ofreciendo el apoyo necesario para que se lleve a cabo en todas las revistas indizadas en Redalyc.

 

  1. ¿El XML podrá exportarse de manera que sea 100% compatible con los estándares para este tipo de archivos que está manejando SciELO-México?

R: SciELO hace parte de la iniciativa JATS4R en la que Redalyc también colabora. Esto permite el reúso de los XML JATS por distintas plataformas que manejan el mismo estándar. Por lo tanto, los XML JATS generados por la herramienta Marcalyc podrán ser utilizados por SciELO México. Al momento de generar este XML JATS, el sistema permite exportarlo con las características que SciELO requiere para su utilización.

 

  1. ¿Existirán plantillas genéricas para la maquetación o se podrá ajustar la maquetación que ya posee la revista?

R: Excelente pregunta. Existen diversas plantillas que Redalyc ofrecerá a los editores, pero el sistema soporta otras maquetaciones. Estos detalles los veremos en las siguientes sesiones.

Entrada destacada

¿Qué es JATS?

JATS (Journal Article Tag Suite) se trata de un estándar técnico, una iniciativa que define un formato XML para describir estructura, semántica y metadatos para contenido digital científico.

Provee de un conjunto de elementos y atributos XML para describir contenido gráfico y de texto de artículos de revista.

JATS es un estándar técnico basado en la Organización Nacional de Estándares de Información (NISO) actualmente en la versión Z39.96 2012 (NISO JATS 1.0).

¿Dónde surge JATS?

  • Años 60’s: Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos (NLM) creó una base de datos de citación de revistas médicas conocida como MEDLINE.
  • 1996: Se creó PubMed, un motor de búsqueda de libre acceso a MEDLINE.
  • 2000: Surge PubMed Central (PMC), repositorio digital desarrollado por el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI), que almacena artículos académicos a texto completo de las revistas biomédicas y de ciencias biológicas de la NLM.
  • 2003 – 2008: NLM introduce 3 versiones del estándar de facto NLM DTD, desde la versión v1.0 a la v3.0.
  • 2012: NISO (National Information Standards Organization) introduce JATS v1.0 como la adaptación de NLM DTD v3.1, convirtiéndose en el estándar XML para marcaje de artículos de revista de publicaciones académicas.

 

Estructura de un archivo JATS

Front. Contiene los metadatos del artículo (título del artículo, revista en la que se publica, fecha, tipo de publicación, copyright, etc. es información bibliográfica del artículo y la revista en la que es publicado.

Body. Es el principal contenido textual y grafico del artículo. Consiste en párrafos y secciones, que pueden incluir figuras, tablas, citas, etc.

Back. Contiene información que auxilia al texto principal, como es el glosario, apéndice, y listado de referencia bibliográfica

Encuentra aquí la especificación completa https://jats.nlm.nih.gov

Preguntas frecuentes acerca de JATS https://jats.nlm.nih.gov/faq.html

¿Te perdiste el primer webinar? aquí el video

Beneficios para la revista en Redalyc

 

  • Otorga mayor visibilidad a cada artículo en la web.
  • Permite la indización y recuperación del texto completo de un documento.
  • Proporciona la generación automática de diversos formatos de salida (HTML, PDF, ePUB).
  • Posibilita la impresión con el formato de la revista.
  • Garantiza la preservación digital.
  • Hace posible el aprovechamiento de visores y lectores multiplataforma.
  • Permite retomar el control del proceso y de los productos editoriales.

 

¿Qué es XML JATS?

Marcalyc

En los casos en los que las revistas no cuenten con su material en formato XML, Redalyc pondrá a su disposición, sin costo alguno, una herramienta tecnológica para su generación, así como capacitación y asesoría continua en el proceso de marcación

Redalyc se suma a XML JATS4R (JATS for Reuse). Para Redalyc es fundamental la reutillización de los archivos XML JATS, tanto como insumo, para poder aprovechar los XML JATS con los que ya cuente la revista, como para compartir con otras plataformas los que se generarán con el sistema Marcalyc de Redalyc. En el caso de las revistas que cuenten con artículos marcados con XML, derivados de la indización en plataformas como PubMed o SciELO, éstos podrán ser reutilizados después de ser sometidos a un proceso de validación, el cual se puede efectuar en el siguiente enlace:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/xmlchecker/

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