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XML JATS en Redalyc

Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas.

Preguntas frecuentes

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  1.  En el caso de las revistas cuyos artículos se encuentran marcados con XML mediante la indización en las plataformas SciELO o e-Pub, ¿quién será responsable por someterlos a validación?

R: Siempre y cuando sean XML JATS no hace falta realizar ninguna verificación, pues se adaptarán a la plataforma de Redalyc inmediatamente. Cabe aclarar que actualmente sólo SciELO Brasil, SciELO Costa Rica y SciELO México están implementando este estándar, y lo están haciendo con los números publicados de 2015 en adelante. Los XML que se pueden descargar desde los demás sitios SciELO o desde los mencionados, de años anteriores no son XML JATS, por lo que no son compatibles con el estándar asumido.

 

  1. ¿Si estamos en esta plataforma, ya no es necesario utilizar OJS?

R: El Open Journal System (OJS) se concibió como un gestor de los procesos editoriales, que en muchos casos está sirviendo de plataforma de publicación de las revistas con muy buenas prestaciones. La marcación en XML JATS y los productos que de ésta se generan serán implementados en primer lugar en el home de la revista en Redalyc, pero el editor podrá descargarlos y hacer uso de ellos como considere. En el momento en que se puedan implementar en OJS lo podrá hacer directamente (esto dependerá de las actualizaciones del OJS). En ningún caso lo generado con la marcación del XML JATS suplantará los procesos editoriales que administra con OJS.

 

  1. Si contamos con un formato PDF, ¿es necesario que se tenga otro formato en esta nueva etapa?

R: La marcación de artículos científicos utilizando el estándar XML JATS permite la modificación del modelo de publicación, el cual ofrece la posibilidad de generar a partir de ésta los productos de publicación y visibilidad de la revista (PDF, HTML, visor inteligente, ePub). Si se ve como un formato de publicación adicional, no implica en ningún caso un cambio obligatorio, pero no permitiría el aprovechamiento de los recursos tecnológicos que este nuevo proceso favorece. En Redalyc, la implementación de un nuevo home de la revista y la generación de productos derivados sólo se hará a partir de los números de revista marcados bajo XML JATS.

 

  1. ¿El marcado que enviamos a PubMed Central va a servir sin modificaciones adicionales para vuestra plataforma cuando implementéis el XML?

R: Si el XML fue marcado con etiquetas JATS, servirá perfectamente. Sin embargo, para salir de dudas recomendamos remitir a Redalyc un archivo XML del que ya envían a PubMed, a fin de realizar la verificación.

 

  1. ¿Es necesario utilizar un plugin adicional para generar los XML JATS, para las revistas que están en la plataforma OJS?

R: Los desarrolladores de Public Knowledge Project – PKP, creadores del OJS, están realizando su propia herramienta de marcación XML JATS. Hasta el momento no se cuenta con información sobre su integración con la plataforma de OJS. A la fecha no existe este plugin.

 

  1. ¿Por qué no se considerarán a las revistas que cobran APC’S?

R: La filosofía de Redalyc sobre el acceso abierto es muy clara. Los desarrollos tecnológicos y científicos generados con recursos públicos deben ser aprovechados por todos, de forma totalmente gratuita. Redalyc ha desarrollado una herramienta tecnológica para que sea aprovechada por su comunidad de editores y autores colaboradores de las revistas. ¿Por qué entregarle gratuitamente una herramienta a una revista que generará sus productos a través de ésta y cobrará a sus autores por su publicación? En América Latina no existe la tradición de que las revistas científicas cobren a sus colaboradores. Redalyc trabaja en función de una comunidad que cuide y proteja el acceso abierto.

 

  1. ¿La marcación de Redalyc impide o restringe la participación en las marcaciones que tienen otros sistemas, como SciELO?

R: No la impide, ya que los XML JATS generados por los dos sistemas son compatibles. Es una opción que se le ofrece al editor, sobre todo porque la marcación en XML JATS dentro de las redes SciELO sólo se está efectuando en Brasil, México y Costa Rica.

 

  1. ¿La identidad de la revista se conservará con la marcación XML JATS?

R: La marcación XML JATS es un estándar y los productos que de ésta se deriven podrán ser personalizados por cada revista dependiendo de la programación que se realice para tal fin. En el caso del visor de los artículos marcados, de los PDF Redalyc y de los ePub, se hará con una salida estándar por la imposibilidad de realizar una personalización a cada una de las 1,138 revistas indizadas en Redalyc. Si el editor desea personalizar sus formatos de salida en la plataforma Redalyc, puede realizar sus propias hojas de estilo y desarrollos para tal fin o ponerse en contacto con Redalyc para definir una estrategia que permita esta personalización.

 

  1. ¿Por qué seguir usando formatos ePub cuando los dispositivos móviles ya soportan otros formatos?

R: La adaptabilidad de un documento (PDF, por ejemplo) para ser leído en un dispositivo móvil, en algunos casos depende de la aplicación con la que fue creado, o incluso de la aplicación con la que se está leyendo en el dispositivo. Los ePub garantizan su legibilidad y mejor manejo, pues son creados especialmente para ello. En todo caso, es un producto adicional que se le ofrece a los editores de las revistas y al usuario en general.

 

  1. ¿La marcación (XML JATS) que se realizará en los artículos a partir del Marcalyc podrá colgarse en las plataformas OJS?

R: Actualmente el OJS sólo permite la descarga de otros formatos y la lectura en formato HTML tradicional del documento según su configuración. Si se “colgara” un documento XML JATS en su plataforma OJS, el usuario sólo podría descargarlo pero no visualizar su contenido con ningún otro formato. La visualización con un visor inteligente requiere un desarrollo propio integrado para la plataforma que aún no se lleva a cabo por parte del equipo desarrollador del OJS.

 

  1. ¿Cuál es el tiempo de vida de los XML JATS?¿Cuál es la razón de usar XML JATS?

R: Es difícil determinar su vida útil, pero aunque el JATS deje de ser un estándar dentro de unos años (pues su adopción ha sido reciente y con una importante receptividad por los más relevantes sistemas metaeditoriales), la garantía de preservación la otorga el formato XML, que con el paso del tiempo siempre podrá ser adaptado a nuevas metodologías.

 

  1. ¿SciELO aceptará los XML JATS de Redalyc y Redalyc aceptará los XML JATS de SciELO?

R: Los dos sistemas asumen el XML JATS como el estándar de marcación de documentos científicos y los dos colaboran con JATS4R con la finalidad de optimizar el uso de los documentos marcados con este estándar, por lo que se asume que, a pesar de que para ser 100% compatibles haya que realizar una leve adaptación a los archivos -por poseer datos propios de cada sistema-, funciona perfectamente para los dos sistemas. Por lo tanto, Redalyc sí aceptará los XML JATS marcados para SciELO.

 

  1. ¿Cuáles serían los requisitos que deben cumplir las revistas para poder trabajar con la herramienta de marcación Marcalyc y generar los XML JATS?

R: Las revistas deben, en un principio, estar indizadas en Redalyc; ser de acceso abierto; no aplicar la política de APC’s (Cargo por Procesamiento de Artículos, APC por sus siglas en inglés) y haber participado en las cuatro sesiones del webinar de capacitación dictado por Redalyc para obtener la certificación respectiva. El uso de esta herramienta no implica ningún costo para el usuario; es completamente gratuita.

 

  1. Los XML podrán ser usados para otras plataformas como SciELO?

R: Efectivamente, el uso del estándar JATS para la generación del XML y el uso por ambas plataformas (Redalyc y SciELO) de las recomendaciones establecidas por la iniciativa de reutilización del JATS for Reuse (JATS4R) permiten este intercambio sin manipulación adicional por parte del usuario. Por ello, Redalyc desarrolló una exportación automática de sus XML JATS para su uso en SciELO.

 

    15. ¿El editor tendrá parte activa en la marcación de los textos en un trabajo conjunto con Marcalyc o el proceso de marcación en su totalidad será realizado por Marcalyc?

R:Marcalyc es la herramienta desarrollada por Redalyc para que el editor pueda marcar sus archivos en formato XML JATS. Si decide utilizarlo, se le dará una clave de acceso.

 

  1. ¿No tendría valor o importancia la estética de las versiones digitales de las revistas? Pues, si se ilustra, diagrama, etc. las plataformas que sostienen las revistas no soportan el peso de las mismas? ¿Cómo fortalecer este aspecto?

R: La intención del XML es rescatar incluso la estética de las versiones digitales; hablaremos más de este tema en las siguientes dos sesiones.

 

  1. ¿Es posible en la plataforma tener una vista previa antes de publicar, como un tipo borrador?

R: Sí es posible tener una vista previa. El sistema, al finalizar el proceso de marcación satisfactoriamente, permitirá al usuario ver el resultado en un visor inteligente, en formato PDF, en HTML, en ePUB, generados automáticamente a partir de su marcación. En caso de querer realizar algún cambio, podrá acceder al Marcalyc nuevamente, editarlo y generar de nuevo, de forma automática, los productos de visualización de su marcación. Éstos podrán ser descargados inmediatamente por el usuario.

 

  1. ¿Las nuevas revistas que estén postulando a Redalyc tendrán que adoptar desde ya estas politicas de XML JATS?

R: No, Redalyc tiene como estrategia desarrollar esta evolución de su plataforma de forma paulatina y flexible, a medida de las posibilidades de las revistas, pero ofreciendo el apoyo necesario para que se lleve a cabo en todas las revistas indizadas en Redalyc.

 

  1. ¿El XML podrá exportarse de manera que sea 100% compatible con los estándares para este tipo de archivos que está manejando SciELO-México?

R: SciELO hace parte de la iniciativa JATS4R en la que Redalyc también colabora. Esto permite el reúso de los XML JATS por distintas plataformas que manejan el mismo estándar. Por lo tanto, los XML JATS generados por la herramienta Marcalyc podrán ser utilizados por SciELO México. Al momento de generar este XML JATS, el sistema permite exportarlo con las características que SciELO requiere para su utilización.

 

  1. ¿Existirán plantillas genéricas para la maquetación o se podrá ajustar la maquetación que ya posee la revista?

R: Excelente pregunta. Existen diversas plantillas que Redalyc ofrecerá a los editores, pero el sistema soporta otras maquetaciones. Estos detalles los veremos en las siguientes sesiones.

Entrada destacada

XML JATS en Redalyc

Redalyc ha emprendido una transición y se suma al estándar XML JATS, bajo la especificación JATS4R, lenguaje de metamarcado con reglas simples, que provee de un método uniforme para describir e intercambiar datos estructurados. Esta transición será paulatina y flexible.

Redalyc se suma a XML JATS4R (JATS for Reuse). Para Redalyc es fundamental la reutillización de los archivos XML JATS, tanto como insumo, para poder aprovechar los XML JATS con los que ya cuente la revista, como para compartir con otras plataformas los que se generarán con el sistema Marcalycde Redalyc. En el caso de las revistas que cuenten con artículos marcados con XML, derivados de la indización en plataformas como PubMed o SciELO, éstos podrán ser reutilizados después de ser sometidos a un proceso de validación, el cual se puede efectuar en el siguiente enlace:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/xmlchecker/

  • En los casos en los que las revistas no cuenten con su material en formato XML, Redalyc pondrá a su disposición, sin costo alguno, una herramienta tecnológica para su generación, así como capacitación y asesoría continua en el proceso de marcación:
  • El 4 de agosto, Redalyc iniciará la impartición de un curso de certificación XML JATS, compuesto por cuatro módulos, a fin de dar a conocer a los editores las ventajas de este sistema de marcación, cada una de las fases de su desarrollo, los modelos de marcadores con las herramientas disponibles en América Latina (Annotum, Scielo y Marcalyc) y la forma de marcar un texto en XML JATS. Al finalizar este curso, los participantes que lo soliciten recibirán una clave de acceso para que puedan hacer uso de Marcalyc en los términos que se indicarán durante las sesiones. En el siguiente enlace usted podrá efectuar el registro correspondiente al curso que se menciona:

https://attendee.gotowebinar.com/register/9160206569091767555

  • El curso de certificación XML JATS consta de cuatro sesiones, las cuales se efectuarán en las siguientes fechas: jueves 4, miércoles 10, jueves 18 y jueves 25 de agosto de 2016, a las 11:00 horas CDT. La fecha límite de inscripción es el 2 de agosto. Los participantes que atiendan a las cuatro sesiones recibirán el certificado respectivo.

Cabe señalar algunos de los beneficios del estándar XML JATS:

  • Otorga mayor visibilidad a cada artículo en la web.
  • Permite la indización y recuperación del texto completo de un documento.
  • Proporciona la generación automática de diversos formatos de salida (HTML, PDF, ePUB).
  • Posibilita la impresión con el formato de la revista.
  • Garantiza la preservación digital.
  • Hace posible el aprovechamiento de visores y lectores multiplataforma.
  • Permite retomar el control del proceso y de los productos editoriales.
Entrada destacada

XML JATS propuesta de Redalyc a las Colecciones SciELO para unificar esfuerzos

Carta enviada al Director SciELO México

 

Carta al Coordinador del Programa SciELO

Primera sesión de 2017 sobre la implementación de XML JATS

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El 6 de abril se efectuó la sesión web denominada “¿Tu revista aún no implementa XML JATS? Conoce lo que Redalyc te ofrece”, la cual estuvo dirigida a las revistas que aún no han implementado XML JATS y a aquéllas que ya lo utilizan, pero tienen dudas en relación con este estándar. Dicha sesión web contó con la participación de 168 personas de 118 instituciones de 13 países, y estuvo a cargo de la doctora Arianna Becerril García, Directora de Tecnología e Innovación de Redalyc.

En la sesión se mencionó que en la actual era de la información es necesario contar con datos más “inteligentes”, es decir, más fáciles de encontrar, procesar y acceder por máquinas. A modo de introducción, se describió qué es un XML, así como la importancia de su uso, y se explicó que el Journal Article Tag Suite (JATS) se trata de un estándar técnico, una iniciativa que define un formato XML para describir estructura, semántica y metadatos para contenido digital científico.

Arianna Becerril señaló que Redalyc garantiza que el XML JATS generado por su sistema de marcación (Marcalyc) es interoperable y compatible con el estándar JATS y la iniciativa JATS4R, y que dicho sistema de información científica busca, entre otras cosas, eliminar las barreras de interoperabilidad y garantizar que los archivos en los que se preserva el contenido científico de las revistas puedan ser reutilizados por otras plataformas.

Agregó que para tener éxito en cuanto al tema de la interoperabilidad es necesario maximizar los acuerdos entre los diferentes actores. También hizo hincapié en que la estrategia de Redalyc para la adopción del estándar XML JATS se basa en dos principios, a saber: la profesionalización de los editores y la reutilización de los archivos. Sobre este último punto, indicó que Redalyc acepta los archivos XML generados por otras plataformas, entre las que se encuentra SciELO, siempre y cuando estén elaborados con base en el estándar JATS. Aclaró que si una revista está indizada en Redalyc y en SciELO no debería ser necesario que se realice la marcación dos veces.

En la parte final de la sesión se explicó el uso de la herramienta Marcalyc, desde la preparación del archivo para la marcación, pasando por la marcación de cada una de las secciones de un documento (front, body y back) hasta llegar a la generación del XML y sus productos (visor inteligente, visor móvil, ePUB, PDF, HTML, XML JATS4R y XML SciELO).

Se explicó que existen dos alternativas para la adopción de XML JATS en Redalyc: el envío a dicho sistema de información de un XML JATS válido (puede ser marcado con otras herramientas) y la marcación con Marcalyc.

Finalmente, se señaló que Redalyc está dispuesto a abrir Marcalyc a revistas indizadas en SciELO aunque no formen parte del acervo de Redalyc, con objeto de que para éstas no sea un factor de exclusión el no contar con recursos y tecnología para marcar en el estándar XML JATS.

Conoce la interoperabilidad XML JATS entre SciELO y Redalyc

Cartas disponibles en español e inglés, respecto a la interoperabilidad #XMLJATS con SciELO.

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Archivos completos:

EAL-español

EAL-ingles

Redalyc continúa innovando con la herramienta de marcación XML JATS Marcalyc

infografia_marcalycb-02Redalyc continúa innovando con Marcalyc.

El 10 enero de este año se liberó la versión 1.1 que recupera las características de versiones anteriores, y añade nuevas, mejorando la experiencia de marcación para los editores de revistas científicas de acceso abierto.

Entre las nuevas características de la versión 1.1 de Marcalyc, se encuentra el reconocimiento automático de 12 diferentes formatos de citación: APA, AMA, CHICAGO, HARVARD, MLA , VANCOUVER, ASA, IEEE, ABNT, ISO 690 y 690-2 (versión 2007) y NLM.

La versión 1.1 de Marcalyc permite a los editores personalizar sus artículos con una imagen de portada que será visible en la tabla de contenido de cada número. De esta forma se ilustra el contenido del artículo.

Con la finalidad de hacer aún más amigable y sencillo el uso de esta herramienta de marcación, Redalyc ha creado un nuevo sitio de apoyo didáctico a los editores: Marcalyc Ayuda (marcalyc.redalyc.org/ayuda/). Este sitio cuenta con videotutoriales, el manual de usuario de Marcalyc, videos del curso de certificación y un apartado de preguntas frecuentes, además de una recopilación de las características de las versiones anteriores de Marcalyc.

Desde el sitio de apoyo es posible vincularse al blog xmljtasredalyc.org, conocer las vías de soporte en línea y conectarse con las redes sociales de Redalyc.

Marcalyc Ayuda refuerza las capacitaciones personalizadas a editores que se han llevado a cabo desde el pasado septiembre.

Marcalyc, liberada el 1 de septiembre de 2016, es una herramienta de marcación XML JATS, servicio gratuito para los editores de revistas indizadas en redalyc.org. Además, es compatible con la recomendación JATS4R.

Redalyc prevé la adhesión de nuevas características a esta herramienta para versiones futuras.

Redalyc 3.0. Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas 

Marcalyc versión 1.0 estable

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La versión 1.0 estable del sistema Marcalyc, tecnología Redalyc, está a pocos días de liberarse.

Esta versión incluye diversas mejoras como la inferencia automática de más formatos de citación, ejemplo de ello son ASA, IEEE, ABNT, ISO 690 y 690-2  (versión 2007) y NLM. Además, esta versión hace un reconocimiento  automático de identificadores en las referencias y notas dentro del artículo, lo que facilita la navegación en el artículo. 

Uno de los cambios más importantes que se integran a dicha versión, es la personalización del idioma dentro del visor inteligente de artículos, además, el mismo visor se mostrará en el idioma original en el que fue escrito cada artículo.

Es importante resaltar que el visor inteligente muestra nuevos elementos del estándar XML JATS, además de estar contenidos en los archivos HTML, PDF y ePub.

Redalyc contempla a los editores como los principales aliados para hacer de la comunicación científica regional, un ente competitivo y colaborativo, por ello, para la versión 1.0 de Marcalyc, se permitirá a los editores subir su propio PDF, si es que así lo desean.

Además, se trabaja en un nuevo sitio de apoyo didáctico a Marcalyc, que incluye videotutoriales, videos del curso de certificación XML JATS, manual de usuario, acceso al blog de Marcalyc y un módulo de preguntas frecuentes.

La liberación de la versión 1.0 de Marcalyc está prevista para el día 9 de diciembre del presente año. Con el desarrollo de tecnología de punta como el sistema Marcalyc, Redalyc refrenda su compromiso con la visibilidad de la ciencia iberoamericana.

Esto es Redalyc 3.0. Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas

 

 

 

Segunda y última sesión del 2do curso de certificación XML JATS en Redalyc

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En la segunda sesión del Curso de Certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS, celebrada el 25 de noviembre, se efectuó un análisis pormenorizado de Marcalyc, la herramienta de marcación generada por Redalyc. Éste tuvo por objeto mostrar los módulos, secciones, atributos y etiquetas que componen este sistema y dar a conocer, paso a paso, el procedimiento para efectuar la marcación de un artículo.

La explicación gráfica del funcionamiento de Marcalyc estuvo a cargo de Fernando Rodríguez, Coordinador del Índice de Revistas Venezolanas, Revencyt, de la Universidad de Los Andes, Venezuela, y de la maestra Eliana Guzmán, profesora de dicha universidad, quienes se encuentran realizando una estancia de investigación en Redalyc.

En esta sesión se reiteró que la marcación debe observar una secuencia lógica (primero se trabaja el front, posteriormente el back y finalmente el body), a fin de posibilitar los enlaces a las referencias y a otras secciones marcadas previamente y que, a su vez, esta vinculación de elementos permite que al final del proceso se efectúe una lectura interactiva de un artículo científico, ya sea en una computadora o en un dispositivo móvil.

Se explicó que para marcar los elementos de un artículo sólo se debe efectuar una operación simple: seleccionar-soltar, ya que el sistema trasladará el elemento seleccionado a la caja correspondiente.

De modo gráfico, se mostró cómo marcar párrafos normales, citas textuales, así como la forma de insertar figuras, gráficos, tablas, ecuaciones y listados. Al terminar la marcación del artículo seleccionado se ejemplificó la experiencia de lectura que permite el visor inteligente y se mostraron los diversos formatos de salida obtenidos.

Finalmente, se atendieron las preguntas formuladas por los participantes.

El curso concluyó con la participación de 16o personas adscritas a 103 instituciones de 15 países.

 

Segundo Curso de certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: marcación XML JATS

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El 24 de noviembre se efectuó la primera sesión del segundo curso web de certificación XML JATS impartido por Redalyc, durante la cual Arianna Becerril y Salvador Chávez, Directora de Tecnología e Innovación y Director de Documentación y Contenido de Redalyc, respectivamente, describieron los antecedentes y conceptos básicos del meta-lenguaje XML y explicaron la importancia de su uso, la estructura de un archivo JATS, su interoperabilidad, el orden del proceso de marcación, las ventajas del estándar XML JATS y el desarrollo de la herramienta Marcalyc por parte del Sistema de Información Científica Redalyc.

En dicha sesión se hizo referencia a los productos derivados de la marcación con Marcalyc, a saber: el visor inteligente, un visor móvil, los formatos ePUB, PDF, HTML, XML JATS4r y XML SciELO, así como el nuevo home de revistas en Redalyc; y se detallaron las alternativas de adopción del XML JATS en dicho sistema de información.

Durante la sesión y en la parte final de ésta se respondieron las preguntas formuladas por los participantes, las cuales versaron principalmente sobre la compatibilidad de los XML JATS manejados por SciELO y Redalyc, la interacción entre OJS y XML JATS y los estilos de citación que reconoce la herramienta Marcalyc.

En la sesión participaron 168 personas adscritas a 107 instituciones de 14 países. El curso concluirá mañana con una sesión práctica sobre el uso de Marcalyc.

Segundo Curso de Certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS

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Después de la excelente respuesta por parte de las y los editores de revistas científicas iberoamericanas, asistentes al primer curso de certificación en marcación XML JATS, se abre un segundo curso con la finalidad de dar a conocer la transición que vive Redalyc hacia Redalyc 3.0, con la adopción del nuevo modelo de publicación bajo el estándar XML JATS.

Esta es la oportunidad para los editores que no pudieron asistir al primer Curso de Certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS.

El segundo curso se llevará a cabo los días 24 y 25 de noviembre del presente año, a las 12 horas del tiempo central de México.

Registro gratuito: https://attendee.gotowebinar.com/register/6939201879907314948

Fecha límite de inscripción: noviembre 22. 18:00 horas.

Manual de usuario Marcalyc

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Estimado editor, Redalyc pone a su alcance el Manual de usuario Marcalyc, tecnología Redalyc, con el fin de hacer más cómodo su uso con este nuevo sistema.

 

 

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