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XML JATS en Redalyc

Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas.

mes

agosto 2016

Aprovechamiento de colores, gráficas, fotografías…

En un PDF generado a partir de la marcación en Marcalyc en XML JATS, se genera un PDF que aprovecha los elementos originales del texto y maximiza su exposición. El caso de un artículo de Atmósfera

 

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PDF derivado del XML JATS

Un nuevo paradigma en el proceso de edición científica: se los platicamos, ya es una realidad. Redalyc genera el PDF de la marcación realizada en Marcalyc facilitando la labor del editor y maximizando la velocidad de comunicación. Mostramos dos pruebas de revistas que se verán el jueves 1 de septiembre: Desacatos.Captura de pantalla 2016-08-30 a las 14.29.18.png

Soy #EditorRedalyc, y me interesa obtener los productos de la marcación XML-JATS, ¿Qué debo hacer?

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Editores, si desean utilizar el sistema Marcalyc, tecnología Redalyc, escriban al correo editores@redalyc.org, hagan explícito su deseo de aprovechar las ventajas que ofrece este sistema ¡y evolucionemos a la revista del futuro!

Tres puntos muy importantes a considerar son los siguientes:

  1. Que la revista esté indexada en Redalyc
  2. Que la revista no cobre APC’S
  3. Que los editores cuenten con una certificación en XML-JATS

Editor, una vez que la revista cumpla con estos requisitos, el equipo Redalyc enviará, mediante un correo, una solicitud de datos así como un acuerdo. Cumplidas las bases se asignará una cuenta de acceso al sistema Marcalyc, así como un asesor personalizado.

Esto es Redalyc 3.0

Un modelo, miles de editores, múltiples plataformas

Septiembre 1, el inicio del cambio…

 

El sistema #Marcalyc, tecnología Redalyc, será liberado el jueves 1 de septiembre del presente año, en medio de la expectación que ha generado en los casi mil editores de revistas científicas iberoamericanas inscritos al Curso de Certificación:  El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS.

Dicho curso se dividió en cuatro sesiones en línea, en las que se mostró, grosso modo, el uso y ventajas de Marcalyc. La respuesta de las y los editores fue magnífica, han mostrado su emoción, interés y disposición para comenzar a explotar las potencialidades de este sistema.

No cabe duda: Marcalyc hará posible que el editor retome el poder del proceso y de los productos editoriales.

Del evento de liberación, a realizarse en el Museo Universitario Leopoldo Flores de la Universidad Autónoma del Estado de México, participarán el Rector de la Máxima Casa de Estudios mexiquense, Dr. Jorge Olvera García, el Director General de Sistema de Información Científica Redalyc, Dr. Eduardo Aguado, la Directora de Tecnología e Innovación, Dra. Arianna Becerril, y el Director de Documentación y Contenido, Tec. Salvador Chávez, además de editores invitados de la universidad estatal.

La transmisión en vivo se hará a través de UAEMéx Televisión, 11:00 hrs. centro.

 

Agosto 18, 2016: 3ª sesión del Curso de Certificación en XML JATS

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En la tercera sesión del Curso de Certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS, celebrada el 18 de agosto, se efectuó un análisis pormenorizado del Marcalyc, la herramienta de marcación generada por Redalyc, con objeto de que las 675personas (de 21 países) que se conectaron a la sesión web se familiarizaran con los módulos, secciones, atributos y etiquetas que componen este sistema y conocieran, paso a paso, el procedimiento para efectuar la marcación de un artículo.

 

Previo a la explicación gráfica del funcionamiento del Marcalyc, la doctora Arianna Becerril, Directora de Tecnología e Innovación de Redalyc, anunció que la versión beta de dicha herramienta se liberará el 1° de septiembre y precisó que ese lanzamiento es el resultado del trabajo realizado durante un año por un equipo de aproximadamente 20 personas, entre las que se encuentran Fernando Rodríguez, Coordinador del Índice de Revistas Venezolanas, Revencyt, de la Universidad de Los Andes, Venezuela y la maestra Eliana Guzmán, profesora de dicha universidad. Agregó que Marcalyc, que funciona en un ambiente web, proporciona una forma de marcar artículos bastante sencilla y reiteró que el uso de esta herramienta no demanda conocimientos técnicos, ya que quien realice el proceso no necesita conocer las más de 260 etiquetas que se encuentran ͞entre bastidores.

 

La doctora Becerril comentó que la marcación de las referencias es la tarea más laboriosa, por lo que hizo hincapié en la necesidad de que las revistas observen cabalmente las normas de citación que adopten, a fin de facilitar este proceso. Dicho lo anterior, Fernando Rodríguez explicó el funcionamiento de Marcalyc, para lo cual utilizó un artículo de la revista Diversitas: Perspectivas en Psicología, de la Universidad Santo Tomás, Colombia, dado que ésta observa un adecuado proceso de citación con base en el formato APA, lo que le permitió al sistema efectuar un proceso de inferencia adecuado.

 

En esta sesión se reiteró que la marcación debe observar una secuencia lógica (primero se trabaja el front, posteriormente el back y finalmente el body), a fin de posibilitar los enlaces a las referencias y a otras secciones marcadas previamente y que, a su vez, esta vinculación de elementos permite que al final del proceso se efectúe una lectura interactiva de un artículo científico, ya sea en una computadora o en un dispositivo móvil. Se explicó que para marcar los elementos de un artículo sólo se debe efectuar una operación simple: seleccionar-soltar, ya que el sistema trasladará el elemento seleccionado a la caja correspondiente. De modo gráfico, se mostró cómo marcar párrafos normales, citas textuales, así como la forma de insertar figuras, gráficos, tablas, ecuaciones y listados, y se aclaró que el sistema permite verificar si se cometieron errores u omisiones durante el proceso.

 

Al terminar la marcación del artículo seleccionado se ejemplificó la experiencia de lectura que permite el visor inteligente y se mostraron los diversos formatos de salida obtenidos (XML, ePub, HTML y PDF). Finalmente, se atendieron algunas preguntas formuladas por los participantes y se recordó que en la cuarta y última sesión del curso se abordarán temas como la comparación de  con las herramientas de otras plataformas, en cuanto a tiempos y costos, y las condiciones establecidas para que los editores puedan utilizar esta herramienta.

Agosto 10, 2016: 2ª sesión del Curso de Certificación en XML JATS

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El 10 de agosto se efectuó la segunda sesión del Curso de Certificación: El nuevo modelo de publicación electrónica y Redalyc 3.0: Marcación XML JATS, la cual se enfocó a explicar qué es y qué no es un XML JATS y a detallar sus antecedentes y ventajas.

Dicha sesión web contó con la participación de 670 personas de 24 países, lo que revela el interés de los editores por adquirir conocimientos sobre esta herramienta. Esta sesión estuvo a cargo de Arianna Becerril García, Directora de Tecnología e Innovación, y de Salvador Chávez Ávila, Director de Documentación y Contenido de Redalyc, quienes, a modo de introducción, analizaron la evolución de la web y de las tecnologías que permiten la comunicación científica, así como el uso de datos inteligentes, para pasar a ubicar al XML en su contexto.

Al respecto, la Dra. Arianna Becerril señaló que la pregunta pertinente en este momento no es si se debe o no migrar hacia el XML sino cómo efectuar dicha migración de la forma más rápida y con el menor costo posible, a fin de recuperar el tiempo perdido y explotar al máximo las ventajas del etiquetado XML en los sitios web de las revistas.

Posteriormente se detallaron las partes o secciones que componen el estándar JATS (front, body y back) y se señaló que Redalyc garantiza que el XML JATS generado por su sistema de marcación (Marcalyc) es interoperable y compatible con el estándar JATS y JATS4R, y que dicho sistema de información científica busca eliminar las barreras para que los archivos en los que ser preserva el contenido científico de las revistas puedan ser reutilizados por otras plataformas.

Finalmente, se respondieron preguntas de los participantes sobre temas como el porcentaje de homologación de las herramientas de marcación de Scielo y Redalyc, los límites de la creación de etiquetas, la reutilización de archivos utilizados por otras plataformas, la marcación de fórmulas matemáticas y las formas de visualización en OJS.

Agosto 4, 2016: 1ª sesión del Curso de Certificación en XML JATS

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El 4 de agosto se efectuó la primera de cuatro sesiones del curso web de certificación XML JATS.

Dicho curso tiene el propósito de dar a conocer a los editores las ventajas de este sistema de marcación, las fases de su desarrollo, los modelos de marcadores con las herramientas disponibles en América Latina y la forma de marcar un texto en XML JATS.

En esta primera sesión, en la que participaron 665 personas, adscritas a 330 instituciones de 23 países, Eduardo Aguado, Arianna Becerril y Salvador Chávez, Director General, Directora de Tecnología e Innovación y Director de Documentación y Contenido de Redalyc, respectivamente, explicaron que el objetivo de sumarse a este estándar internacional es empoderar a los editores y a la comunicación científica de la región, así como garantizar un acceso abierto no comercial, sustentable y competitivo.

En la sesión también se abordaron temas como las nuevas condiciones de la comunicación electrónica, la pérdida de identidad de las revistas y las particularidades de la publicación continua. El doctor Aguado señaló que muchas revistas electrónicas no han sabido aprovechar los avances tecnológicos y se han convertido solamente en un clon de sus versiones impresas.

Al respecto, se indicó que el hecho de sumarse a XML JATS permitirá aprovechar al máximo las ventajas de la edición electrónica con objeto de posicionar a la publicaciones, recuperar la belleza, eficiencia e identidad de las revistas impresas en el ámbito digital, potenciar el papel de la multimedia para pasar de la lectura lineal que se efectuaba mediante el PDF a una lectura hipertextual y de esta forma nutrir el discurso científico de la región.

Durante la sesión y en la parte final de ésta se formularon 376 preguntas, las cuales versaron, entre otros, sobre los siguientes temas: ¿son compatibles los XML JATS manejados por Scielo y Redalyc?, ¿el OJS responde a las necesidades de los nuevos sistemas de publicación?, ¿XML JATS permite preservar la información? Cabe señalar que muchas de las preguntas formuladas se refieren a aspectos técnicos, los cuales serán abordados en las sesiones del miércoles 10, jueves 18 y jueves 25 del presente mes.

Preguntas frecuentes

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  1.  En el caso de las revistas cuyos artículos se encuentran marcados con XML mediante la indización en las plataformas SciELO o e-Pub, ¿quién será responsable por someterlos a validación?

R: Siempre y cuando sean XML JATS no hace falta realizar ninguna verificación, pues se adaptarán a la plataforma de Redalyc inmediatamente. Cabe aclarar que actualmente sólo SciELO Brasil, SciELO Costa Rica y SciELO México están implementando este estándar, y lo están haciendo con los números publicados de 2015 en adelante. Los XML que se pueden descargar desde los demás sitios SciELO o desde los mencionados, de años anteriores no son XML JATS, por lo que no son compatibles con el estándar asumido.

 

  1. ¿Si estamos en esta plataforma, ya no es necesario utilizar OJS?

R: El Open Journal System (OJS) se concibió como un gestor de los procesos editoriales, que en muchos casos está sirviendo de plataforma de publicación de las revistas con muy buenas prestaciones. La marcación en XML JATS y los productos que de ésta se generan serán implementados en primer lugar en el home de la revista en Redalyc, pero el editor podrá descargarlos y hacer uso de ellos como considere. En el momento en que se puedan implementar en OJS lo podrá hacer directamente (esto dependerá de las actualizaciones del OJS). En ningún caso lo generado con la marcación del XML JATS suplantará los procesos editoriales que administra con OJS.

 

  1. Si contamos con un formato PDF, ¿es necesario que se tenga otro formato en esta nueva etapa?

R: La marcación de artículos científicos utilizando el estándar XML JATS permite la modificación del modelo de publicación, el cual ofrece la posibilidad de generar a partir de ésta los productos de publicación y visibilidad de la revista (PDF, HTML, visor inteligente, ePub). Si se ve como un formato de publicación adicional, no implica en ningún caso un cambio obligatorio, pero no permitiría el aprovechamiento de los recursos tecnológicos que este nuevo proceso favorece. En Redalyc, la implementación de un nuevo home de la revista y la generación de productos derivados sólo se hará a partir de los números de revista marcados bajo XML JATS.

 

  1. ¿El marcado que enviamos a PubMed Central va a servir sin modificaciones adicionales para vuestra plataforma cuando implementéis el XML?

R: Si el XML fue marcado con etiquetas JATS, servirá perfectamente. Sin embargo, para salir de dudas recomendamos remitir a Redalyc un archivo XML del que ya envían a PubMed, a fin de realizar la verificación.

 

  1. ¿Es necesario utilizar un plugin adicional para generar los XML JATS, para las revistas que están en la plataforma OJS?

R: Los desarrolladores de Public Knowledge Project – PKP, creadores del OJS, están realizando su propia herramienta de marcación XML JATS. Hasta el momento no se cuenta con información sobre su integración con la plataforma de OJS. A la fecha no existe este plugin.

 

  1. ¿Por qué no se considerarán a las revistas que cobran APC’S?

R: La filosofía de Redalyc sobre el acceso abierto es muy clara. Los desarrollos tecnológicos y científicos generados con recursos públicos deben ser aprovechados por todos, de forma totalmente gratuita. Redalyc ha desarrollado una herramienta tecnológica para que sea aprovechada por su comunidad de editores y autores colaboradores de las revistas. ¿Por qué entregarle gratuitamente una herramienta a una revista que generará sus productos a través de ésta y cobrará a sus autores por su publicación? En América Latina no existe la tradición de que las revistas científicas cobren a sus colaboradores. Redalyc trabaja en función de una comunidad que cuide y proteja el acceso abierto.

 

  1. ¿La marcación de Redalyc impide o restringe la participación en las marcaciones que tienen otros sistemas, como SciELO?

R: No la impide, ya que los XML JATS generados por los dos sistemas son compatibles. Es una opción que se le ofrece al editor, sobre todo porque la marcación en XML JATS dentro de las redes SciELO sólo se está efectuando en Brasil, México y Costa Rica.

 

  1. ¿La identidad de la revista se conservará con la marcación XML JATS?

R: La marcación XML JATS es un estándar y los productos que de ésta se deriven podrán ser personalizados por cada revista dependiendo de la programación que se realice para tal fin. En el caso del visor de los artículos marcados, de los PDF Redalyc y de los ePub, se hará con una salida estándar por la imposibilidad de realizar una personalización a cada una de las 1,138 revistas indizadas en Redalyc. Si el editor desea personalizar sus formatos de salida en la plataforma Redalyc, puede realizar sus propias hojas de estilo y desarrollos para tal fin o ponerse en contacto con Redalyc para definir una estrategia que permita esta personalización.

 

  1. ¿Por qué seguir usando formatos ePub cuando los dispositivos móviles ya soportan otros formatos?

R: La adaptabilidad de un documento (PDF, por ejemplo) para ser leído en un dispositivo móvil, en algunos casos depende de la aplicación con la que fue creado, o incluso de la aplicación con la que se está leyendo en el dispositivo. Los ePub garantizan su legibilidad y mejor manejo, pues son creados especialmente para ello. En todo caso, es un producto adicional que se le ofrece a los editores de las revistas y al usuario en general.

 

  1. ¿La marcación (XML JATS) que se realizará en los artículos a partir del Marcalyc podrá colgarse en las plataformas OJS?

R: Actualmente el OJS sólo permite la descarga de otros formatos y la lectura en formato HTML tradicional del documento según su configuración. Si se “colgara” un documento XML JATS en su plataforma OJS, el usuario sólo podría descargarlo pero no visualizar su contenido con ningún otro formato. La visualización con un visor inteligente requiere un desarrollo propio integrado para la plataforma que aún no se lleva a cabo por parte del equipo desarrollador del OJS.

 

  1. ¿Cuál es el tiempo de vida de los XML JATS?¿Cuál es la razón de usar XML JATS?

R: Es difícil determinar su vida útil, pero aunque el JATS deje de ser un estándar dentro de unos años (pues su adopción ha sido reciente y con una importante receptividad por los más relevantes sistemas metaeditoriales), la garantía de preservación la otorga el formato XML, que con el paso del tiempo siempre podrá ser adaptado a nuevas metodologías.

 

  1. ¿SciELO aceptará los XML JATS de Redalyc y Redalyc aceptará los XML JATS de SciELO?

R: Los dos sistemas asumen el XML JATS como el estándar de marcación de documentos científicos y los dos colaboran con JATS4R con la finalidad de optimizar el uso de los documentos marcados con este estándar, por lo que se asume que, a pesar de que para ser 100% compatibles haya que realizar una leve adaptación a los archivos -por poseer datos propios de cada sistema-, funciona perfectamente para los dos sistemas. Por lo tanto, Redalyc sí aceptará los XML JATS marcados para SciELO.

 

  1. ¿Cuáles serían los requisitos que deben cumplir las revistas para poder trabajar con la herramienta de marcación Marcalyc y generar los XML JATS?

R: Las revistas deben, en un principio, estar indizadas en Redalyc; ser de acceso abierto; no aplicar la política de APC’s (Cargo por Procesamiento de Artículos, APC por sus siglas en inglés) y haber participado en las cuatro sesiones del webinar de capacitación dictado por Redalyc para obtener la certificación respectiva. El uso de esta herramienta no implica ningún costo para el usuario; es completamente gratuita.

 

  1. Los XML podrán ser usados para otras plataformas como SciELO?

R: Efectivamente, el uso del estándar JATS para la generación del XML y el uso por ambas plataformas (Redalyc y SciELO) de las recomendaciones establecidas por la iniciativa de reutilización del JATS for Reuse (JATS4R) permiten este intercambio sin manipulación adicional por parte del usuario. Por ello, Redalyc desarrolló una exportación automática de sus XML JATS para su uso en SciELO.

 

    15. ¿El editor tendrá parte activa en la marcación de los textos en un trabajo conjunto con Marcalyc o el proceso de marcación en su totalidad será realizado por Marcalyc?

R:Marcalyc es la herramienta desarrollada por Redalyc para que el editor pueda marcar sus archivos en formato XML JATS. Si decide utilizarlo, se le dará una clave de acceso.

 

  1. ¿No tendría valor o importancia la estética de las versiones digitales de las revistas? Pues, si se ilustra, diagrama, etc. las plataformas que sostienen las revistas no soportan el peso de las mismas? ¿Cómo fortalecer este aspecto?

R: La intención del XML es rescatar incluso la estética de las versiones digitales; hablaremos más de este tema en las siguientes dos sesiones.

 

  1. ¿Es posible en la plataforma tener una vista previa antes de publicar, como un tipo borrador?

R: Sí es posible tener una vista previa. El sistema, al finalizar el proceso de marcación satisfactoriamente, permitirá al usuario ver el resultado en un visor inteligente, en formato PDF, en HTML, en ePUB, generados automáticamente a partir de su marcación. En caso de querer realizar algún cambio, podrá acceder al Marcalyc nuevamente, editarlo y generar de nuevo, de forma automática, los productos de visualización de su marcación. Éstos podrán ser descargados inmediatamente por el usuario.

 

  1. ¿Las nuevas revistas que estén postulando a Redalyc tendrán que adoptar desde ya estas politicas de XML JATS?

R: No, Redalyc tiene como estrategia desarrollar esta evolución de su plataforma de forma paulatina y flexible, a medida de las posibilidades de las revistas, pero ofreciendo el apoyo necesario para que se lleve a cabo en todas las revistas indizadas en Redalyc.

 

  1. ¿El XML podrá exportarse de manera que sea 100% compatible con los estándares para este tipo de archivos que está manejando SciELO-México?

R: SciELO hace parte de la iniciativa JATS4R en la que Redalyc también colabora. Esto permite el reúso de los XML JATS por distintas plataformas que manejan el mismo estándar. Por lo tanto, los XML JATS generados por la herramienta Marcalyc podrán ser utilizados por SciELO México. Al momento de generar este XML JATS, el sistema permite exportarlo con las características que SciELO requiere para su utilización.

 

  1. ¿Existirán plantillas genéricas para la maquetación o se podrá ajustar la maquetación que ya posee la revista?

R: Excelente pregunta. Existen diversas plantillas que Redalyc ofrecerá a los editores, pero el sistema soporta otras maquetaciones. Estos detalles los veremos en las siguientes sesiones.

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